為促進神經科學之發展與研究，增進國內外有關神經醫學之學術團體與學人之聯繫與合作，由施純仁教授等32位國內神經醫學之泰斗發起籌備，於民國六十六年（西元1977年）三月六日創立。

　　成立之初定名為「中華民國神經學學會」，包括神經內外科、神經放射科、小兒神經科、基礎神經學、臨床神經生理學、腦中風、癲癇等範疇。近年來因專業分工之故，陸續成立癲癇學會（79）、基礎神經學學會（81）、神經外科醫學會（82）、腦中風學會（84/3）、神經放射線醫學會（84/6）、小兒神經醫學會（85）、臨床神經生理學學會（87）。為因應現代之民主潮流，於民國八十八年四月十日之會員大會中提案由『中華民國神經學學會』更名為「台灣神經學學會」，5月7日內政部已核准通過（文號：台（88）內社字第八八一七七九九號函），六月頒發新立案證書與圖記。

　　神外與小兒之專科相關業務已交與其所屬學會辦理，學會業務亦由繁入簡，到89年6月份止，入會會員已累計到1373位，實際活動之人數約莫1000人，主要負責衛生署委託之神經科專科醫院評鑑與神經科醫師甄審，目前神經科專科醫師累計至491位（統計至89年6月止），及與國內外各機關之來往行政庶務、舉辦相關學術研討會等。

　　1991年洪慶章理事長任內，委任台大醫院神經科陳榮基教授籌辦屬於學會自己的學術雜誌，以季刊方式自1992年3月發行第一期，最初名為「Acta Neurologica Sinica」，後來由於現實情況需要，乃於1996年9月起出版的雜誌開始改名為「Acta Neurologica Taiwanica」。中文名稱原為「中華民國神經學雜誌」1999年配合學會更名為「台灣神經學雜誌」，為台灣本土神經醫學盡一份心力。

　　近年來積極聯繫神經醫學相關學會，於1999年舉辦第一屆神經醫學聯合學術研討會，更成立了「神經醫學相關學會歷任理事長、秘書長聯誼會」，由施純仁教授擔任會長，神經學學會現任理事長擔任秘書長，為整合神經醫學而努力，在邁入二十一世紀之際，完成『台灣醫學發展史料輯錄』，以利後世之參考。